Mus musculus Gene: Cdh3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-189956.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Cdh3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | cadherin 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI385538; Cadp; Cdhp; P-cadherin; Pcad | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000061048 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
cadherin 3
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a calcium-dependent cell-cell adhesion protein containing five cadherin domains. The encoded protein plays a role in epithelial outgrowth, such as that which occurs during the development of hair follicles and limb buds. Loss of function of the related gene in humans results in ectodermal dysplasia, ectrodactyly, and macular dystrophy and congential hypotrichosis with juvenile macular dystrophy. This gene is located in the vicinity of similar cadherin genes on chromosome 8. The proprotein is further cleaved into a functional chain. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Mar 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 8:106510913-106556908 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | D3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 9 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Cell-cell junction organization pathway
Adherens junctions interactions pathway
Cell junction organization pathway
Cell-Cell communication pathway
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KEGG |
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
EGFR1 pathway
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REACTOME |
Adherens junctions interactions pathway
Cell-Cell communication pathway
Cell junction organization pathway
Cell-cell junction organization pathway
Cell junction organization pathway
Cell-Cell communication pathway
Cell-cell junction organization pathway
Adherens junctions interactions pathway
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KEGG |
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P10287 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q80VY6 Q8BRE1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 12560 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.398498 Mm.4658 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001037809 NM_007665 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS22637 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:88356 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Cdh3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AK031265 AK045041 BC052189 BC098459 CH466525 D12688 X06340 X68057 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH52189 AAH98459 BAA02186 BAC27327 BAC32194 CAA29646 EDL11369 EDL11370 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 12560 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||