Mus musculus Gene: Phf21a | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-192007.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Phf21a | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | PHD finger protein 21A | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000058318 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
PHD finger protein 21A
PHD finger protein 21A
PHD finger protein 21A
PHD finger protein 21A
PHD finger protein 21A
PHD finger protein 21A
PHD finger protein 21A
PHD finger protein 21A
PHD finger protein 21A
PHD finger protein 21A
PHD finger protein 21A
PHD finger protein 21A
PHD finger protein 21A
PHD finger protein 21A
PHD finger protein 21A
PHD finger protein 21A
PHD finger protein 21A
PHD finger protein 21A
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000135365:
The PHF21A gene encodes BHC80, a component of a BRAF35 (MIM 605535)/histone deacetylase (HDAC; see MIM 601241) complex (BHC) that mediates repression of neuron-specific genes through the cis-regulatory element known as repressor element-1 (RE1) or neural restrictive silencer (NRS) (Hakimi et al., 2002 [PubMed 12032298]).[supplied by OMIM, Nov 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:92093117-92364666 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | E1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 9 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Factors involved in megakaryocyte development and platelet production pathway
HDACs deacetylate histones pathway
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
Hemostasis pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A2AHG3 E0CZ79 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 192285 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.330408 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_138755 NM_001109690 NM_001109691 XM_006498959 XM_006498960 XM_006498961 XM_006498962 XM_006498963 XM_006498964 XM_006498965 XM_006498966 XM_006498967 XM_006498968 XM_006498969 XM_006498970 XM_006498971 XM_006498972 XM_006498973 XM_006498974 XM_006498975 XM_006498976 XM_006498977 XM_006498978 XM_006498979 XM_006498980 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS16442 CCDS50644 CCDS50645 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:2384756 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Phf21a | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AL691462 AL731709 AL732484 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 192285 | ||||||||||||||||||||||