Mus musculus Gene: Mc1r | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-199166.6 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Mc1r | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | melanocortin 1 receptor | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | e; Mshra; Tob | ||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000074037 | ||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
melanocortin 1 receptor
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000258839:
This intronless gene encodes the receptor protein for melanocyte-stimulating hormone (MSH). The encoded protein, a seven pass transmembrane G protein coupled receptor, controls melanogenesis. Two types of melanin exist: red pheomelanin and black eumelanin. Gene mutations that lead to a loss in function are associated with increased pheomelanin production, which leads to lighter skin and hair color. Eumelanin is photoprotective but pheomelanin may contribute to UV-induced skin damage by generating free radicals upon UV radiation. Binding of MSH to its receptor activates the receptor and stimulates eumelanin synthesis. This receptor is a major determining factor in sun sensitivity and is a genetic risk factor for melanoma and non-melanoma skin cancer. Over 30 variant alleles have been identified which correlate with skin and hair color, providing evidence that this gene is an important component in determining normal human pigment variation. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 8:123407082-123410742 | ||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||
Band | E1 | ||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
G alpha (s) signalling events pathway
GPCR downstream signaling pathway
Signaling by GPCR pathway
Class A/1 (Rhodopsin-like receptors) pathway
GPCR ligand binding pathway
Peptide ligand-binding receptors pathway
Signal Transduction pathway
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KEGG |
Melanogenesis pathway
Neuroactive ligand-receptor interaction pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
G alpha (s) signalling events pathway
Peptide ligand-binding receptors pathway
Class A/1 (Rhodopsin-like receptors) pathway
Signaling by GPCR pathway
Signal Transduction pathway
GPCR downstream signaling pathway
GPCR ligand binding pathway
Peptide ligand-binding receptors pathway
Signaling by GPCR pathway
G alpha (s) signalling events pathway
Signal Transduction pathway
GPCR downstream signaling pathway
GPCR ligand binding pathway
Class A/1 (Rhodopsin-like receptors) pathway
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KEGG |
Neuroactive ligand-receptor interaction pathway
Melanogenesis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q01727 | ||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D5MR23 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 17199 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.324942 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_008559 | ||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS22756 | ||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:99456 | ||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Mc1r | ||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB177607 AB177608 AB306322 AB504815 AB504817 AB504818 BC119294 BC119296 CH466525 X65635 | ||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI19295 AAI19297 BAD16659 BAD16660 BAG85190 BAJ07144 BAJ07146 BAJ07147 CAA46589 EDL11741 | ||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 17199 | ||||||||||||||||||||||||||||