Mus musculus Gene: Xcl1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-202545.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Xcl1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | chemokine (C motif) ligand 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI661682; ATAC; Lptn; LTN; SCM-1; SCM-1a; Scyc1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000026573 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
chemokine (C motif) ligand 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000143184:
This gene encodes a member of the chemokine superfamily. Chemokines function in inflammatory and immunological responses, inducing leukocyte migration and activation. The encoded protein is a member of the C-chemokine subfamily, retaining only two of four cysteines conserved in other chemokines, and is thought to be specifically chemotactic for T cells. This gene and a closely related family member are located on the long arm of chromosome 1. [provided by RefSeq, Nov 2010] This antimicrobial gene encodes a member of the chemokine superfamily. Chemokines function in inflammatory and immunological responses, inducing leukocyte migration and activation. The encoded protein is a member of the C-chemokine subfamily, retaining only two of four cysteines conserved in other chemokines, and is thought to be specifically chemotactic for T cells. This gene and a closely related family member are located on the long arm of chromosome 1. [provided by RefSeq, Sep 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:164931644-164935527 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | H2.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
GPCR downstream signaling pathway
Signaling by GPCR pathway
Class A/1 (Rhodopsin-like receptors) pathway
Gastrin-CREB signalling pathway via PKC and MAPK pathway
GPCR ligand binding pathway
Peptide ligand-binding receptors pathway
Chemokine receptors bind chemokines pathway
G alpha (q) signalling events pathway
Signal Transduction pathway
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KEGG |
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Chemokine signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
G alpha (q) signalling events pathway
Gastrin-CREB signalling pathway via PKC and MAPK pathway
Chemokine receptors bind chemokines pathway
Peptide ligand-binding receptors pathway
Class A/1 (Rhodopsin-like receptors) pathway
Signaling by GPCR pathway
Signal Transduction pathway
GPCR downstream signaling pathway
GPCR ligand binding pathway
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KEGG |
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Chemokine signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P47993 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q542T1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 16963 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.190 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_008510 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS15438 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:104593 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Xcl1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AK079820 BC062249 CH466520 D43769 U15607 U28491 U28492 U28493 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA56752 AAA69801 AAH62249 BAA07826 BAC37756 EDL39243 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 16963 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||