Mus musculus Gene: Stx1a | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-203389.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Stx1a | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | syntaxin 1A (brain) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | HPC-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000007207 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
syntaxin 1A (brain)
syntaxin 1A (brain)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000106089:
This gene encodes a member of the syntaxin superfamily. Syntaxins are nervous system-specific proteins implicated in the docking of synaptic vesicles with the presynaptic plasma membrane. Syntaxins possess a single C-terminal transmembrane domain, a SNARE [Soluble NSF (N-ethylmaleimide-sensitive fusion protein)-Attachment protein REceptor] domain (known as H3), and an N-terminal regulatory domain (Habc). Syntaxins bind synaptotagmin in a calcium-dependent fashion and interact with voltage dependent calcium and potassium channels via the C-terminal H3 domain. This gene product is a key molecule in ion channel regulation and synaptic exocytosis. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.[provided by RefSeq, Sep 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:135023482-135051100 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||
Band | G2 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 41 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 37 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Integration of energy metabolism pathway
GABA synthesis, release, reuptake and degradation pathway
Acetylcholine Neurotransmitter Release Cycle pathway
Metabolism pathway
Regulation of insulin secretion pathway
Neurotransmitter Release Cycle pathway
Norepinephrine Neurotransmitter Release Cycle pathway
Neuronal System pathway
Glutamate Neurotransmitter Release Cycle pathway
Transmission across Chemical Synapses pathway
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KEGG |
SNARE interactions in vesicular transport pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Insulin processing pathway
Regulation of insulin secretion pathway
Integration of energy metabolism pathway
Neurotoxicity of clostridium toxins pathway
Dopamine Neurotransmitter Release Cycle pathway
Acetylcholine Neurotransmitter Release Cycle pathway
Serotonin Neurotransmitter Release Cycle pathway
Glutamate Neurotransmitter Release Cycle pathway
GABA synthesis, release, reuptake and degradation pathway
Norepinephrine Neurotransmitter Release Cycle pathway
Neuronal System pathway
Uptake and actions of bacterial toxins pathway
Metabolism of proteins pathway
Transmission across Chemical Synapses pathway
Neurotransmitter Release Cycle pathway
Metabolism pathway
Peptide hormone metabolism pathway
Disease pathway
Toxicity of botulinum toxin type C (BoNT/C) pathway
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KEGG |
SNARE interactions in vesicular transport pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Effects of Botulinum toxin
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.408860 Mm.6225 | ||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_016801 | ||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS19731 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||