Mus musculus Gene: Idh3b | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-206291.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Idh3b | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | isocitrate dehydrogenase 3 (NAD+) beta | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000027406 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
isocitrate dehydrogenase 3 (NAD+) beta
isocitrate dehydrogenase 3 (NAD+) beta
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000101365:
Isocitrate dehydrogenases catalyze the oxidative decarboxylation of isocitrate to 2-oxoglutarate. These enzymes belong to two distinct subclasses, one of which utilizes NAD(+) as the electron acceptor and the other NADP(+). Five isocitrate dehydrogenases have been reported: three NAD(+)-dependent isocitrate dehydrogenases, which localize to the mitochondrial matrix, and two NADP(+)-dependent isocitrate dehydrogenases, one of which is mitochondrial and the other predominantly cytosolic. NAD(+)-dependent isocitrate dehydrogenases catalyze the allosterically regulated rate-limiting step of the tricarboxylic acid cycle. Each isozyme is a heterotetramer that is composed of two alpha subunits, one beta subunit, and one gamma subunit. The protein encoded by this gene is the beta subunit of one isozyme of NAD(+)-dependent isocitrate dehydrogenase. Three alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:130279309-130284547 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | F1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 7 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Citrate cycle (TCA cycle) pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Citric acid cycle (TCA cycle) pathway
Pyruvate metabolism and Citric Acid (TCA) cycle pathway
The citric acid (TCA) cycle and respiratory electron transport pathway
Metabolism pathway
The citric acid (TCA) cycle and respiratory electron transport pathway
Metabolism pathway
Pyruvate metabolism and Citric Acid (TCA) cycle pathway
Citric acid cycle (TCA cycle) pathway
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KEGG |
Citrate cycle (TCA cycle) pathway
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INOH |
Citrate cycle pathway
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PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q91VA7 V9GXV0 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 170718 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.29590 Mm.486612 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_130884 XM_006498824 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS16738 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:2158650 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Idh3b | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AL833804 AY035212 BC009022 CH466519 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH09022 AAK64606 EDL28255 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 170718 | ||||||||||||||||||||||