Mus musculus Gene: Spop | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-209590.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Spop | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | speckle-type POZ protein | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI315626; Pcif1; TEF2 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000057522 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
speckle-type POZ protein
speckle-type POZ protein
speckle-type POZ protein
speckle-type POZ protein
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000121067:
This gene encodes a protein that may modulate the transcriptional repression activities of death-associated protein 6 (DAXX), which interacts with histone deacetylase, core histones, and other histone-associated proteins. In mouse, the encoded protein binds to the putative leucine zipper domain of macroH2A1.2, a variant H2A histone that is enriched on inactivated X chromosomes. The BTB/POZ domain of this protein has been shown in other proteins to mediate transcriptional repression and to interact with components of histone deacetylase co-repressor complexes. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants encoding the same protein. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:95414080-95493406 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | D | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 8 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 26 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Hedgehog signaling events mediated by Gli proteins
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | B1ATK7 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 20747 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.285454 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_025287 XM_006532692 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS36286 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1343085 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Spop | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AL662875 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 20747 | ||||||||||||||||||||||