Mus musculus Gene: Jmjd6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-214522.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Jmjd6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | jumonji domain containing 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 5730436I23Rik; D11Ertd195e; mKIAA0585; PSR; PtdSerR; Ptdsr | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000056962 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
jumonji domain containing 6
jumonji domain containing 6
jumonji domain containing 6
jumonji domain containing 6
jumonji domain containing 6
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] Reversible arginine methylation of TRAF6 is regulated by PRMT1 and JMJD6 and this in turn regulates TRAF6-dependent TLR signalling.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a nuclear protein with a JmjC domain. JmjC domain-containing proteins are predicted to function as protein hydroxylases or histone demethylases. This protein functions in differentiation of multiple tissues during development, and in anti-inflammatory cytokine signaling. It was first identified as a putative phosphatidylserine receptor involved in phagocytosis of apoptotic cells; however, subsequent studies have indicated that this protein does not directly function in the clearance of apoptotic cells, and questioned whether it is a true phosphatidylserine receptor. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:116837432-116843449 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | E2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.383423 Mm.436739 Mm.481684 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_033398 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS25678 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||