Homo sapiens Gene: RNF138 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-2188.7 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RNF138 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | ring finger protein 138, E3 ubiquitin protein ligase | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000134758 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ring finger protein 138
ring finger protein 138
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene contains a RING finger, a motif present in a variety of functionally distinct proteins and known to be involved in protein-DNA and protein-protein interactions. Alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been observed. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 18:32091855-32131561 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q12.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 14 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | J3KSI2 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 51444 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.302408 Hs.661501 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001191324 NM_016271 NM_198128 XM_005258286 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:17765 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS11903 CCDS11904 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 11508 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC011825 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 51444 | ||||||||||||||||||||||