Homo sapiens Gene: SEMA3E | |||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-24532.6 | ||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SEMA3E | ||||||||||||||||||||
Gene Name | sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3E | ||||||||||||||||||||
Synonyms | coll-5; M-SEMAH; M-SemaK; SEMAH | ||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000170381 | ||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3E
sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3E
sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3E
sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3E
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||
Summary |
Semaphorins are a large family of conserved secreted and membrane associated proteins which possess a semaphorin (Sema) domain and a PSI domain (found in plexins, semaphorins and integrins) in the N-terminal extracellular portion. Based on sequence and structural similarities, semaphorins are put into eight classes: invertebrates contain classes 1 and 2, viruses have class V, and vertebrates contain classes 3-7. Semaphorins serve as axon guidance ligands via multimeric receptor complexes, some (if not all) containing plexin proteins. This gene encodes a class 4 semaphorin. This gene encodes a class 3 semaphorin. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.[provided by RefSeq, May 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 7:83363906-83649010 | ||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||
Band | q21.11 | ||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||
REACTOME |
Other semaphorin interactions pathway
Developmental Biology pathway
Semaphorin interactions pathway
Axon guidance pathway
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KEGG |
Axon guidance pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||
PID NCI |
Plexin-D1 Signaling
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Cross-References | |||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.528721 Hs.630822 Hs.642416 | ||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001178129 NM_012431 XM_006716187 | ||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS34674 CCDS55121 | ||||||||||||||||||||
HPRD | 11545 | ||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||