Homo sapiens Gene: CHRNA5 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-24824.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CHRNA5 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | cholinergic receptor, nicotinic, alpha 5 (neuronal) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | LNCR2 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000169684 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
cholinergic receptor, nicotinic, alpha 5
cholinergic receptor, nicotinic, alpha 5
cholinergic receptor, nicotinic, alpha 5
cholinergic receptor, nicotinic, alpha 5
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a nicotinic acetylcholine receptor subunit and a member of a superfamily of ligand-gated ion channels that mediate fast signal transmission at synapses. These receptors are thought to be heteropentamers composed of separate but similar subunits. Defects in this gene have been linked to susceptibility to lung cancer type 2 (LNCR2).[provided by RefSeq, Jun 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:78565520-78595269 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q25.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Neuronal System pathway
Highly calcium permeable nicotinic acetylcholine receptors pathway
Postsynaptic nicotinic acetylcholine receptors pathway
Activation of Nicotinic Acetylcholine Receptors pathway
Presynaptic nicotinic acetylcholine receptors pathway
Transmission across Chemical Synapses pathway
Highly calcium permeable postsynaptic nicotinic acetylcholine receptors pathway
Neurotransmitter Receptor Binding And Downstream Transmission In The Postsynaptic Cell pathway
Acetylcholine Binding And Downstream Events pathway
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KEGG |
Neuroactive ligand-receptor interaction pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 1138 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.1614 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_000745 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:1959 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 118505 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS10304 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 00334 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 1138 | ||||||||||||||||||||||