Homo sapiens Gene: NUP54 | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-25315.6 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | NUP54 | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | nucleoporin 54kDa | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000138750 | ||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
nucleoporin 54kDa
nucleoporin 54kDa
nucleoporin 54kDa
nucleoporin 54kDa
nucleoporin 54kDa
nucleoporin 54kDa
nucleoporin 54kDa
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The nuclear envelope creates distinct nuclear and cytoplasmic compartments in eukaryotic cells. It consists of two concentric membranes perforated by nuclear pores, large protein complexes that form aqueous channels to regulate the flow of macromolecules between the nucleus and the cytoplasm. These complexes are composed of at least 100 different polypeptide subunits, many of which belong to the nucleoporin family. This gene encodes a member of the phe-gly (FG) repeat-containing nucleoporin subset. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 4:76114659-76148515 | ||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||
Band | q21.1 | ||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 20 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
ISG15 antiviral mechanism pathway
Regulation of Glucokinase by Glucokinase Regulatory Protein pathway
Glucose transport pathway
Hexose transport pathway
Nuclear import of Rev protein pathway
Vpr-mediated nuclear import of PICs pathway
Rev-mediated nuclear export of HIV RNA pathway
Viral Messenger RNA Synthesis pathway
Late Phase of HIV Life Cycle pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Influenza Infection pathway
Interactions of Vpr with host cellular proteins pathway
Myoclonic epilepsy of Lafora pathway
Antiviral mechanism by IFN-stimulated genes pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Metabolism of carbohydrates pathway
Transcriptional regulation by small RNAs pathway
Nuclear Pore Complex (NPC) Disassembly pathway
Influenza Viral RNA Transcription and Replication pathway
Interferon Signaling pathway
Cell Cycle pathway
Immune System pathway
M Phase pathway
HIV Life Cycle pathway
Mitotic Prophase pathway
Cell Cycle, Mitotic pathway
HIV Infection pathway
Influenza Life Cycle pathway
Metabolism pathway
Host Interactions of HIV factors pathway
SLC-mediated transmembrane transport pathway
Interactions of Rev with host cellular proteins pathway
Gene Expression pathway
Nuclear Envelope Breakdown pathway
Disease pathway
Glycogen storage diseases pathway
Regulatory RNA pathways pathway
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KEGG |
RNA transport pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D6RFI8 | ||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 53371 | ||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.430435 Hs.740016 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001278603 NM_017426 XM_006714236 XM_006714237 XM_006714238 | ||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:17359 | ||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 607607 | ||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS3576 CCDS63998 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 06352 | ||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC110795 AC112719 | ||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 53371 | ||||||||||||||||||||||||||