Homo sapiens Gene: TRIM5 | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-27690.6 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TRIM5 | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | tripartite motif containing 5 | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000132256 | ||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
tripartite motif containing 5
tripartite motif containing 5
tripartite motif containing 5
tripartite motif containing 5
tripartite motif containing 5
tripartite motif containing 5
tripartite motif containing 5
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
TRIM5 is upregulated by Type I and Type II interferons and have been found to restrict viral replication by modulating the RIG-I pathway.
TRIM5 is an innate intracellular HIV restriction factor that is upregulated by type I interferons.
TRIM5 was identified in a systematic screen for positive regulators of innate immune responses.
TRIM5 requires UBE2W, UBE2N and UBE2V2 enzymatic activities to inhibit retroviral DNA synthesis
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a member of the tripartite motif (TRIM) family. The TRIM motif includes three zinc-binding domains, a RING, a B-box type 1 and a B-box type 2, and a coiled-coil region. The protein forms homo-oligomers via the coilel-coil region and localizes to cytoplasmic bodies. It appears to function as a E3 ubiquitin-ligase and ubiqutinates itself to regulate its subcellular localization. It may play a role in retroviral restriction. Multiple alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:5663557-5938619 | ||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||
Band | p15.4 | ||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 53 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||
No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_033034 NM_033092 NM_033093 XM_005253183 XM_005253184 XM_006718358 | ||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS31392 CCDS31393 CCDS31394 | ||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 07004 | ||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||