Homo sapiens Gene: HLA-DQB2 | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-303869.4 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | HLA-DQB2 | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | major histocompatibility complex, class II, DQ beta 2 | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | HLA-DQB1; HLA-DXB | ||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000232629 | ||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
major histocompatibility complex, class II, DQ beta 2
major histocompatibility complex, class II, DQ beta 2
major histocompatibility complex, class II, DQ beta 2
major histocompatibility complex, class II, DQ beta 2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
HLA-DQB2 belongs to the family of HLA class II beta chain paralogs. Class II molecules are heterodimers consisting of an alpha (DQA) and a beta chain (DQB), both anchored in the membrane. They play a central role in the immune system by presenting peptides derived from extracellular proteins. Class II molecules are expressed in antigen presenting cells (APC: B lymphocytes, dendritic cells, macrophages). Polymorphisms in the alpha and beta chains specify the peptide binding specificity, and typing for these polymorphisms is routinely done for bone marrow transplantation. However this gene, HLA-DQB2, is not routinely typed, as it is not thought to have an effect on transplantation. There is conflicting evidence in the literature and public sequence databases for the protein-coding capacity of HLA-DQB2. Because there is evidence of transcription and an intact ORF, HLA-DQB2 is represented in Entrez Gene and in RefSeq as a protein-coding locus. [provided by RefSeq, Oct 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:32756098-32763534 | ||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||
Band | p21.32 | ||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
MHC class II antigen presentation pathway
Downstream TCR signaling pathway
Generation of second messenger molecules pathway
Translocation of ZAP-70 to Immunological synapse pathway
Phosphorylation of CD3 and TCR zeta chains pathway
Interferon gamma signaling pathway
PD-1 signaling pathway
Costimulation by the CD28 family pathway
TCR signaling pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Interferon Signaling pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.731563 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001198858 NM_001300790 XM_005249051 XM_005275546 | ||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS56419 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 09984 | ||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||