Homo sapiens Gene: EXOSC9 | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-36262.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | EXOSC9 | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | exosome component 9 | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | p5; p6; PM/Scl-75; PMSCL1; RRP45; Rrp45p | ||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000123737 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
exosome component 9
exosome component 9
exosome component 9
exosome component 9
exosome component 9
exosome component 9
exosome component 9
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a component of the human exosome, a exoribonuclease complex which processes and degrades RNA in the nucleus and cytoplasm. This component may play a role in mRNA degradation and the polymyositis/scleroderma autoantigen complex. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 4:121801317-121817021 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | q27 | ||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 34 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Butyrate Response Factor 1 (BRF1) destabilizes mRNA pathway
Tristetraprolin (TTP) destabilizes mRNA pathway
KSRP destabilizes mRNA pathway
mRNA decay by 3' to 5' exoribonuclease pathway
ATF4 activates genes pathway
PERK regulates gene expression pathway
Unfolded Protein Response (UPR) pathway
Deadenylation-dependent mRNA decay pathway
Metabolism of proteins pathway
Regulation of mRNA stability by proteins that bind AU-rich elements pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
RNA degradation pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.620415 Hs.91728 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001034194 NM_005033 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS34057 CCDS3722 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | 07315 | ||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||