Homo sapiens Gene: COPZ1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-37816.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | COPZ1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | coatomer protein complex, subunit zeta 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | COPZ; HSPC181; zeta-COP; zeta1-COP | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000111481 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
coatomer protein complex, subunit zeta 1
coatomer protein complex, subunit zeta 1
coatomer protein complex, subunit zeta 1
coatomer protein complex, subunit zeta 1
coatomer protein complex, subunit zeta 1
coatomer protein complex, subunit zeta 1
coatomer protein complex, subunit zeta 1
coatomer protein complex, subunit zeta 1
coatomer protein complex, subunit zeta 1
coatomer protein complex, subunit zeta 1
coatomer protein complex, subunit zeta 1
coatomer protein complex, subunit zeta 1
coatomer protein complex, subunit zeta 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a subunit of the cytoplasmic coatamer protein complex, which is involved in autophagy and intracellular protein trafficking. The coatomer protein complex is comprised of seven subunits and functions as the coat protein of coat protein complex (COP)I-vesicles. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Nov 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 12:54301202-54351849 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q13.13 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 29 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
COPI Mediated Transport pathway
Golgi to ER Retrograde Transport pathway
Membrane Trafficking pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.505652 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001271734 NM_001271735 NM_001271736 NM_016057 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS61137 CCDS61138 CCDS61139 CCDS8877 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 16738 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||