Homo sapiens Gene: IFNA1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-54276.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | IFNA1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | interferon, alpha 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | IFL; IFN; IFN-ALPHA; IFN-alphaD; IFNA@; IFNA13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000197919 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
interferon, alpha 1
interferon, alpha 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
IFNA1 activates NF-kappaB in JAK1-deficient cells through a TYK2-dependent pathway where for the IFN signalling pathway leading to STAT activation, both JAK1 and TYK2 are essential, but NF-kappaB activation requires only TYK2.
IFNA1 induces the human anti-inflammatory cytokine IL-10 gene via a module consisting of interdependent IRF1 and STAT3 motifs.
IFNA1 sensitizes cells to microbial recognition by up-regulating the expression of several TLRs as well as adapter molecules and kinases involved in TLR signalling.
IFNA1 is a type I interferon (IFN) that binds to the IFN receptor (IFNAR), composed of two transmembrane polypeptides, IFNAR1 and IFNAR2;IL10RB.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is produced by macrophages and has antiviral activity. This gene is intronless and the encoded protein is secreted. [provided by RefSeq, Sep 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:21409169-21441316 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p21.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 13 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||
No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
TRAF6 mediated IRF7 activation pathway
RIG-I/MDA5 mediated induction of IFN-alpha/beta pathways pathway
Regulation of IFNA signaling pathway
Interferon alpha/beta signaling pathway
Factors involved in megakaryocyte development and platelet production pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Innate Immune System pathway
Interferon Signaling pathway
Immune System pathway
Hemostasis pathway
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KEGG |
Regulation of autophagy pathway
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Toll-like receptor signaling pathway pathway
Jak-STAT signaling pathway pathway
Natural killer cell mediated cytotoxicity pathway
Autoimmune thyroid disease pathway
RIG-I-like receptor signaling pathway pathway
Cytosolic DNA-sensing pathway pathway
Hepatitis C pathway
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INOH |
JAK STAT pathway and regulation pathway
GPCR signaling pathway
IFN alpha signaling pathway
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PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_024013 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS6508 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||