Homo sapiens Gene: CRY1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-55047.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CRY1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | cryptochrome 1 (photolyase-like) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | PHLL1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000008405 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
cryptochrome 1 (photolyase-like)
cryptochrome 1 (photolyase-like)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a flavin adenine dinucleotide-binding protein that is a key component of the circadian core oscillator complex, which regulates the circadian clock. The encoded protein is widely conserved across plants and animals. Loss of the related gene in mouse results in a shortened circadian cycle in complete darkness. [provided by RefSeq, Aug 2012] This gene encodes a flavin adenine dinucleotide-binding protein that is a key component of the circadian core oscillator complex, which regulates the circadian clock. This gene is upregulated by CLOCK/ARNTL heterodimers but then represses this upregulation in a feedback loop using PER/CRY heterodimers to interact with CLOCK/ARNTL. Polymorphisms in this gene have been associated with altered sleep patterns. The encoded protein is widely conserved across plants and animals. Loss of the related gene in mouse results in a shortened circadian cycle in complete darkness. [provided by RefSeq, Jan 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 12:106991364-107093829 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q23.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 29 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 25 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
BMAL1:CLOCK,NPAS2 activates circadian gene expression pathway
Circadian Clock pathway
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KEGG |
Circadian rhythm pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | H0YHT0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 1407 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.151573 Hs.739819 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_004075 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:2384 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 601933 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS9112 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 09050 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC007541 AC078929 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 1407 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||