Homo sapiens Gene: PHF16 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-59451.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | PHF16 | ||||||||||||||||||
Gene Name | PHD finger protein 16 | ||||||||||||||||||
Synonyms | JADE-3; PHF16 | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000102221 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
PHD finger protein 16
PHD finger protein 16
jade family PHD finger 3
jade family PHD finger 3
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
This gene is part of a gene cluster on chromosome Xp11.23. The encoded protein contains a zinc finger motif often found in transcriptional regulators, however, its exact function is not known. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding the same protein. [provided by RefSeq, Jul 2008] This gene encodes a member of a family of large proteins containing PHD (plant homeo domain)-type zinc fingers. The encoded protein may be associated in a nuclear complex that functions in histone H4 acetylation. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding the same protein. [provided by RefSeq, Aug 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome X:46912276-47061242 | ||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
Band | p11.3 | ||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
HATs acetylate histones pathway
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | F2Z2B6 F2Z3N8 | ||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 9767 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.371977 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001077445 NM_014735 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:22982 | ||||||||||||||||||
OMIM | 300618 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS14271 | ||||||||||||||||||
HPRD | 06675 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AL627143 Z83822 | ||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 9767 | ||||||||||||||||||