Version 5.4
| Homo sapiens Gene: PHF16 | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-59451.6 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | PHF16 | ||||||||||||||||||
| Gene Name | PHD finger protein 16 | ||||||||||||||||||
| Synonyms | JADE-3; PHF16 | ||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Gene | ENSG00000102221 | ||||||||||||||||||
| Encoded Proteins |
PHD finger protein 16
PHD finger protein 16
jade family PHD finger 3
jade family PHD finger 3
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| Protein Structure | |||||||||||||||||||
| Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||
| Summary |
This gene is part of a gene cluster on chromosome Xp11.23. The encoded protein contains a zinc finger motif often found in transcriptional regulators, however, its exact function is not known. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding the same protein. [provided by RefSeq, Jul 2008] This gene encodes a member of a family of large proteins containing PHD (plant homeo domain)-type zinc fingers. The encoded protein may be associated in a nuclear complex that functions in histone H4 acetylation. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding the same protein. [provided by RefSeq, Aug 2013] |
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| Gene Information | |||||||||||||||||||
| Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
| Genomic Location | Chromosome X:46912276-47061242 | ||||||||||||||||||
| Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
| Band | p11.3 | ||||||||||||||||||
| Transcripts |
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| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Orthologs | |||||||||||||||||||
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Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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| Pathways | |||||||||||||||||||
| NETPATH | |||||||||||||||||||
| REACTOME |
HATs acetylate histones pathway
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
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| KEGG | |||||||||||||||||||
| INOH | |||||||||||||||||||
| PID NCI | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | |||||||||||||||||||
| TrEMBL | F2Z2B6 F2Z3N8 | ||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 9767 | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.371977 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NM_001077445 NM_014735 | ||||||||||||||||||
| HUGO | HGNC:22982 | ||||||||||||||||||
| OMIM | 300618 | ||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS14271 | ||||||||||||||||||
| HPRD | 06675 | ||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | AL627143 Z83822 | ||||||||||||||||||
| GenPept | |||||||||||||||||||
| RNA Seq Atlas | 9767 | ||||||||||||||||||