Homo sapiens Gene: RPS4Y1 | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-6.6 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RPS4Y1 | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | ribosomal protein S4, Y-linked 1 | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000129824 | ||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ribosomal protein S4, Y-linked 1
ribosomal protein S4, Y-linked 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Cytoplasmic ribosomes, organelles that catalyze protein synthesis, consist of a small 40S subunit and a large 60S subunit. Together these subunits are composed of 4 RNA species and approximately 80 structurally distinct proteins. This gene encodes ribosomal protein S4, a component of the 40S subunit. Ribosomal protein S4 is the only ribosomal protein known to be encoded by more than one gene, namely this gene and ribosomal protein S4, X-linked (RPS4X). The 2 isoforms encoded by these genes are not identical, but are functionally equivalent. Ribosomal protein S4 belongs to the S4E family of ribosomal proteins. It has been suggested that haploinsufficiency of the ribosomal protein S4 genes plays a role in Turner syndrome; however, this hypothesis is controversial. As is typical for genes encoding ribosomal proteins, there are multiple processed pseudogenes of this gene dispersed through the genome. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome Y:2841486-2932000 | ||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||
Band | p11.2 | ||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 8 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||
No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
L13a-mediated translational silencing of Ceruloplasmin expression pathway
Nonsense Mediated Decay (NMD) independent of the Exon Junction Complex (EJC) pathway
Nonsense Mediated Decay (NMD) enhanced by the Exon Junction Complex (EJC) pathway
GTP hydrolysis and joining of the 60S ribosomal subunit pathway
Translation initiation complex formation pathway
Activation of the mRNA upon binding of the cap-binding complex and eIFs, and subsequent binding to 43S pathway
Formation of a pool of free 40S subunits pathway
Formation of the ternary complex, and subsequently, the 43S complex pathway
Ribosomal scanning and start codon recognition pathway
Eukaryotic Translation Termination pathway
Peptide chain elongation pathway
Eukaryotic Translation Elongation pathway
SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane pathway
Viral mRNA Translation pathway
Eukaryotic Translation Initiation pathway
Influenza Infection pathway
Nonsense-Mediated Decay (NMD) pathway
Influenza Viral RNA Transcription and Replication pathway
Translation pathway
Metabolism of proteins pathway
Cap-dependent Translation Initiation pathway
Influenza Life Cycle pathway
Gene Expression pathway
Disease pathway
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KEGG |
Ribosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001008 | ||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS14773 | ||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 15963 | ||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||