Bos taurus Gene: USF1 | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-630225.3 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | USF1 | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | Upstream stimulatory factor 1 | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000017873 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Upstream stimulatory factor 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000158773:
This gene encodes a member of the basic helix-loop-helix leucine zipper family, and can function as a cellular transcription factor. The encoded protein can activate transcription through pyrimidine-rich initiator (Inr) elements and E-box motifs. This gene has been linked to familial combined hyperlipidemia (FCHL). Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants. A related pseudogene has been defined on chromosome 21. [provided by RefSeq, Feb 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:8455700-8461692 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 52 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Signaling mediated by p38-alpha and p38-beta
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.52208 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001001161 XM_005203454 XM_005203455 XM_005203456 XM_005203457 XM_005203458 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||