Bos taurus Gene: RAB13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-632584.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RAB13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | Ras-related protein Rab-13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000017604 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ras-related protein Rab-13
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000143545:
This gene is a member of the Rab family of small G proteins and plays a role in regulating membrane trafficking between trans-Golgi network (TGN) and recycling endosomes (RE). The encoded protein is involved in the assembly of tight junctions, which are components of the apical junctional complex (AJC) of epithelial cells. The AJC plays a role in forming a barrier between luminal contents and the underlying tissue. Additional functions associated with the protein include endocytic recycling of occludin, regulation of epithelial cell scattering, neuronal regeneration and regulation of neurite outgrowth. Alternately spliced transcript variants have been observed for this gene. A pseudogene associated with this gene is located on chromosome 12. [provided by RefSeq, Jan 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:16511100-16515182 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 6 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Translocation of GLUT4 to the plasma membrane pathway
Membrane Trafficking pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Translocation of GLUT4 to the plasma membrane pathway
Membrane Trafficking pathway
Membrane Trafficking pathway
Translocation of GLUT4 to the plasma membrane pathway
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KEGG |
Tight junction pathway
Tight junction pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q58DS5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 514541 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.4127 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001024540 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | BC109840 BT021522 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI09841 AAX46369 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 514541 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||