Bos taurus Gene: PAFAH1B1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-633101.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PAFAH1B1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit alpha | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | LIS-1; LIS1; MDCR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000016806 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit alpha
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000007168:
This locus was identified as encoding a gene that when mutated or lost caused the lissencephaly associated with Miller-Dieker lissencephaly syndrome. This gene encodes the non-catalytic alpha subunit of the intracellular Ib isoform of platelet-activating factor acteylhydrolase, a heterotrimeric enzyme that specifically catalyzes the removal of the acetyl group at the SN-2 position of platelet-activating factor (identified as 1-O-alkyl-2-acetyl-sn-glyceryl-3-phosphorylcholine). Two other isoforms of intracellular platelet-activating factor acetylhydrolase exist: one composed of multiple subunits, the other, a single subunit. In addition, a single-subunit isoform of this enzyme is found in serum. [provided by RefSeq, Apr 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:24088805-24158415 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 38 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Resolution of Sister Chromatid Cohesion pathway
Mitotic Prometaphase pathway
Separation of Sister Chromatids pathway
Regulation of PLK1 Activity at G2/M Transition pathway
Loss of Nlp from mitotic centrosomes pathway
Loss of proteins required for interphase microtubule organization� from the centrosome pathway
Recruitment of mitotic centrosome proteins and complexes pathway
Cell Cycle pathway
M Phase pathway
Mitotic Anaphase pathway
Centrosome maturation pathway
G2/M Transition pathway
Cell Cycle, Mitotic pathway
Mitotic G2-G2/M phases pathway
Mitotic Metaphase and Anaphase pathway
Recruitment of mitotic centrosome proteins and complexes pathway
G2/M Transition pathway
Cell Cycle, Mitotic pathway
Separation of Sister Chromatids pathway
Resolution of Sister Chromatid Cohesion pathway
Loss of Nlp from mitotic centrosomes pathway
Cell Cycle pathway
M Phase pathway
Mitotic G2-G2/M phases pathway
Loss of proteins required for interphase microtubule organization� from the centrosome pathway
Mitotic Metaphase and Anaphase pathway
Mitotic Prometaphase pathway
Regulation of PLK1 Activity at G2/M Transition pathway
Mitotic Anaphase pathway
Centrosome maturation pathway
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KEGG |
Ether lipid metabolism pathway
Ether lipid metabolism pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Reelin signaling pathway
Lissencephaly gene (LIS1) in neuronal migration and development
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A5D7P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 282513 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.111460 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_174663 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | BC140633 DAAA02048674 DAAA02048675 DAAA02048676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI40634 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 282513 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||