Bos taurus Gene: NTRK2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-636149.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | NTRK2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | BDNF/NT-3 growth factors receptor precursor | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Trk-B; TrkB | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000010647 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
BDNF/NT-3 growth factors receptor
BDNF/NT-3 growth factors receptor
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000148053:
This gene encodes a member of the neurotrophic tyrosine receptor kinase (NTRK) family. This kinase is a membrane-bound receptor that, upon neurotrophin binding, phosphorylates itself and members of the MAPK pathway. Signalling through this kinase leads to cell differentiation. Mutations in this gene have been associated with obesity and mood disorders. Alternate transcriptional splice variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] This gene encodes a member of the neurotrophic tyrosine receptor kinase (NTRK) family. This kinase is a membrane-bound receptor that, upon neurotrophin binding, phosphorylates itself and members of the MAPK pathway. Signalling through this kinase leads to cell differentiation. Mutations in this gene have been associated with obesity and mood disorders. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, May 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 8:79336288-79743284 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 27 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
NGF-independant TRKA activation pathway
Signalling by NGF pathway
Signal Transduction pathway
NGF signalling via TRKA from the plasma membrane pathway
Activation of TRKA receptors pathway
Signalling by NGF pathway
NGF signalling via TRKA from the plasma membrane pathway
Signal Transduction pathway
NGF-independant TRKA activation pathway
Activation of TRKA receptors pathway
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KEGG |
MAPK signaling pathway pathway
Neurotrophin signaling pathway pathway
MAPK signaling pathway pathway
Neurotrophin signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Neurotrophic factor-mediated Trk receptor signaling
Posttranslational regulation of adherens junction stability and dissassembly
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q0VCN4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 505824 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.106683 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001075225 XM_005210377 XM_005210371 XM_005210372 XM_005210373 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | BC120085 DAAA02023921 DAAA02023922 DAAA02023923 DAAA02023924 DAAA02023925 DAAA02023926 DAAA02023927 DAAA02023928 DAAA02023929 DAAA02023930 DAAA02023931 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI20086 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 505824 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||