Bos taurus Gene: HDAC1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-644586.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | HDAC1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | Histone deacetylase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000012698 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Histone deacetylase 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary | Currently no Entrez Summary Available. You might want to check the Summary Sections of the Orthologs. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:122055992-122087843 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
APC truncation mutants have impaired AXIN binding pathway
G0 and Early G1 pathway
Signaling by Wnt pathway
Signaling by WNT in cancer pathway
Signaling by NOTCH1 t(7;9)(NOTCH1:M1580_K2555) Translocation Mutant pathway
Generic Transcription Pathway pathway
S33 mutants of beta-catenin aren't phosphorylated pathway
Epigenetic regulation of gene expression pathway
Signaling by NOTCH pathway
Mitotic G1-G1/S phases pathway
Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants in Cancer pathway
Loss of Function of TGFBR1 in Cancer pathway
p75NTR negatively regulates cell cycle via SC1 pathway
Signaling by TGF-beta Receptor Complex pathway
SMAD2/3 MH2 Domain Mutants in Cancer pathway
Factors involved in megakaryocyte development and platelet production pathway
RNA Polymerase I, RNA Polymerase III, and Mitochondrial Transcription pathway
TCF dependent signaling in response to WNT pathway
Loss of Function of SMAD4 in Cancer pathway
RNA Polymerase I Transcription pathway
misspliced LRP5 mutants have enhanced beta-catenin-dependent signaling pathway
S37 mutants of beta-catenin aren't phosphorylated pathway
Constitutive Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants pathway
deactivation of the beta-catenin transactivating complex pathway
deletions in the AXIN genes in hepatocellular carcinoma result in elevated WNT signaling pathway
Loss of Function of TGFBR2 in Cancer pathway
Gene Expression pathway
Hemostasis pathway
Chromatin organization pathway
phosphorylation site mutants of CTNNB1 are not targeted to the proteasome by the destruction complex pathway
Cell Cycle, Mitotic pathway
HDACs deacetylate histones pathway
truncations of AMER1 destabilize the destruction complex pathway
AXIN mutants destabilize the destruction complex, activating WNT signaling pathway
NOTCH1 Intracellular Domain Regulates Transcription pathway
XAV939 inhibits tankyrase, stabilizing AXIN pathway
Cell Cycle pathway
Signaling by NOTCH1 in Cancer pathway
TGFBR2 Kinase Domain Mutants in Cancer pathway
Signal Transduction pathway
AXIN missense mutants destabilize the destruction complex pathway
Constitutive Signaling by NOTCH1 PEST Domain Mutants pathway
NoRC negatively regulates rRNA expression pathway
Signaling by TGF-beta Receptor Complex in Cancer pathway
misspliced GSK3beta mutants stabilize beta-catenin pathway
Signaling by NOTCH1 pathway
repression of WNT target genes pathway
TCF7L2 mutants don't bind CTBP pathway
Transcriptional activity of SMAD2/SMAD3:SMAD4 heterotrimer pathway
deletions in the AMER1 gene destabilize the destruction complex pathway
RNA Polymerase I Transcription Initiation pathway
Signalling by NGF pathway
AMER1 mutants destabilize the destruction complex pathway
Signaling by NOTCH1 PEST Domain Mutants in Cancer pathway
Negative epigenetic regulation of rRNA expression pathway
RNF mutants show enhanced WNT signaling and proliferation pathway
FBXW7 Mutants and NOTCH1 in Cancer pathway
SMAD4 MH2 Domain Mutants in Cancer pathway
TGFBR2 MSI Frameshift Mutants in Cancer pathway
p75 NTR receptor-mediated signalling pathway
Signaling by NOTCH1 HD Domain Mutants in Cancer pathway
S45 mutants of beta-catenin aren't phosphorylated pathway
Downregulation of SMAD2/3:SMAD4 transcriptional activity pathway
formation of the beta-catenin:TCF transactivating complex pathway
APC truncation mutants are not K63 polyubiquitinated pathway
RNA Polymerase I Promoter Clearance pathway
Loss of Function of SMAD2/3 in Cancer pathway
TGFBR1 LBD Mutants in Cancer pathway
Disease pathway
Degradation of beta-catenin by the destruction complex pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
SMAD2/3 Phosphorylation Motif Mutants in Cancer pathway
TGFBR1 KD Mutants in Cancer pathway
T41 mutants of beta-catenin aren't phosphorylated pathway
truncated APC mutants destabilize the destruction complex pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q32PJ8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q6RCM7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 404126 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.16500 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001037444 XM_005202895 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AY504948 BC108088 BT030718 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI08089 AAR98734 ABS45034 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 404126 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||