Bos taurus Gene: RORA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-646570.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RORA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | nuclear receptor ROR-alpha | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000015904 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
RAR-related orphan receptor A
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] The transcription factor RORA is critical for the development of nuocytes and the mounting of innate type 2 immunity against parasitic worms. (Demonstrated in mice)
[Mus musculus] The transcription factor Rora is critical for the development of nuocytes and the mounting of innate type 2 immunity against parasitic worms.
[Mus musculus] Nlrp3 is a novel molecular target for melatonin which requires Rora to blunt the NFkB/ NLRP3 connection during sepsis.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a member of the NR1 subfamily of nuclear hormone receptors. It can bind as a monomer or as a homodimer to hormone response elements upstream of several genes to enhance the expression of those genes. The encoded protein has been shown to interact with NM23-2, a nucleoside diphosphate kinase involved in organogenesis and differentiation, as well as with NM23-1, the product of a tumor metastasis suppressor candidate gene. Also, it has been shown to aid in the transcriptional regulation of some genes involved in circadian rhythm. [provided by RefSeq, Feb 2014] |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 10:48949618-49750993 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 26 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
|
Gene ID
Gene Order
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
PPARA activates gene expression pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
RORA activates circadian gene expression pathway
BMAL1:CLOCK,NPAS2 activates circadian gene expression pathway
REV-ERBA represses gene expression pathway
Circadian Clock pathway
Nuclear Receptor transcription pathway pathway
Generic Transcription Pathway pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Metabolism pathway
Gene Expression pathway
Rora activates circadian gene expression pathway
Circadian Clock pathway
Mus musculus biological processes pathway
Nuclear Receptor transcription pathway pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
Circadian Clock pathway
REV-ERBA represses gene expression pathway
RORA activates circadian gene expression pathway
Metabolism pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Gene Expression pathway
PPARA activates gene expression pathway
Generic Transcription Pathway pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Circadian rhythm pathway
Circadian rhythm pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
HIF-1-alpha transcription factor network
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F1N7R0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 790889 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.56061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001192861 XM_005211703 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:10258 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02028778 DAAA02028779 DAAA02028780 DAAA02028781 DAAA02028782 DAAA02028783 DAAA02028784 DAAA02028785 DAAA02028786 DAAA02028787 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 535597 790889 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||