Version 5.4
Homo sapiens Gene: SPATA16
Summary
InnateDB Gene IDBG-65265.6
Last Modified 2014-10-13 [Report errors or provide feedback]
Gene Symbol SPATA16
Gene Name spermatogenesis associated 16
Synonyms
Species Homo sapiens
Ensembl Gene ENSG00000144962
Encoded Proteins
IDBP-65267
spermatogenesis associated 16
Protein Structure
Useful resources Stemformatics EHFPI ImmGen
Entrez Gene
Summary This gene encodes a testis-specific protein that belongs to the tetratricopeptide repeat-like superfamily. The encoded protein localizes to the Golgi apparatus and may play a role in spermatogenesis. [provided by RefSeq, May 2010]
Gene Information
Type Protein coding
Genomic Location Chromosome 3:172889358-173141268
Strand Reverse strand
Band q26.31
Transcripts
ENST00000351008 ENSP00000341765
Interactions
Number of Interactions This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
Experimentally validated
Total 2 [view]
Protein-Protein 2 [view]
Protein-DNA 0
Protein-RNA 0
DNA-DNA 0
RNA-RNA 0
DNA-RNA 0
Gene Ontology

Molecular Function
Accession GO Term
Biological Process
GO:0007275 multicellular organismal development
GO:0007283 spermatogenesis
GO:0030154 cell differentiation
Cellular Component
GO:0005794 Golgi apparatus
Orthologs
Species
Mus musculus
Bos taurus
Gene ID
Gene Order
ENSMUSG00000039335
View Gene Order
ENSBTAG00000031802
Not yet available
Cross-References
SwissProt Q9BXB7
TrEMBL
UniProt Splice Variant
Entrez Gene 83893
UniGene Hs.444236
RefSeq NM_031955 XM_006713778
HUGO HGNC:29935
OMIM 609856
CCDS CCDS3221
HPRD
IMGT
EMBL AC063933 AC092948 AF345909 AF404758 BC034496 DQ141866 DQ141867 DQ141868 DQ141869 DQ141870 DQ141871 DQ141872 DQ141873 DQ141874 DQ141875 DQ141876 DQ141877 DQ141878 DQ141879 DQ141880 DQ141881 DQ141882 DQ141883 DQ141884 DQ141885 DQ141886 DQ141887 DQ141888 DQ141889 DQ141890 DQ141891 DQ141892 DQ141893 DQ141894 DQ141895 DQ141896 DQ141897 DQ141898 DQ141899 DQ141900 DQ141901 DQ141902 DQ141903 DQ141904 DQ141905 DQ141906 DQ141907 DQ141908 DQ141909 DQ141910 DQ141911 DQ141912 DQ141913 DQ141914 DQ141915 DQ141916 DQ141917 DQ141918 DQ141919 DQ141920 DQ141921 DQ141922 DQ141923 DQ141924 DQ141925 DQ141926 DQ141927 DQ141928 DQ141929 DQ141930 DQ141931 DQ141932 DQ141933 DQ141934 DQ141935 DQ141936 DQ141937 DQ141944 DQ141945 DQ141946 DQ141947 DQ141948 DQ141949 DQ141950 DQ141951 DQ141952 DQ141953 DQ141954 DQ141955 DQ141956 DQ141957 DQ141958 DQ141959 DQ141960 DQ141961 DQ141962 DQ141963 DQ141964 DQ141965 DQ141966 DQ141967 DQ141968 DQ141969 DQ141970 DQ141971 DQ141972 DQ141973 DQ141974 DQ141975 DQ141976 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RNA Seq Atlas 83893

If you use InnateDB for your research, please cite the following publication:

Breuer et al., InnateDB: systems biology of innate immunity and beyond - recent updates and continuing curation. Nucl. Acids Res. (2013) 41 (D1) 

InnateDB is being developed jointly by the Brinkman Laboratory (Simon Fraser University, British Columbia, Canada), the Hancock Laboratory (University of British Columbia, Vancouver, British Columbia) and the Lynn EMBL Australia Group (South Australian Health & Medical Research Institute and Flinders University, Adelaide, Australia).

Funding is currently provided by Allergen and EMBL Australia. Previous funding has been provided by Genome Canada, the Foundation for the National Institutes of Health through the Grand Challenges in Global Health initiative and by Teagasc. InnateDB curated interactions are licensed under the Design Science License. All other data is licensed under the terms of the originating database. Contact: innatedb-mail@sfu.ca