Version 5.4
| Homo sapiens Gene: MRPL47 | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-66351.6 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | MRPL47 | ||||||||||||||||||
| Gene Name | mitochondrial ribosomal protein L47 | ||||||||||||||||||
| Synonyms | |||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Gene | ENSG00000136522 | ||||||||||||||||||
| Encoded Proteins |
mitochondrial ribosomal protein L47
mitochondrial ribosomal protein L47
mitochondrial ribosomal protein L47
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| Protein Structure |
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| Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||
| Summary |
Mammalian mitochondrial ribosomal proteins are encoded by nuclear genes and help in protein synthesis within the mitochondrion. Mitochondrial ribosomes (mitoribosomes) consist of a small 28S subunit and a large 39S subunit. They have an estimated 75% protein to rRNA composition compared to prokaryotic ribosomes, where this ratio is reversed. Another difference between mammalian mitoribosomes and prokaryotic ribosomes is that the latter contain a 5S rRNA. Among different species, the proteins comprising the mitoribosome differ greatly in sequence, and sometimes in biochemical properties, which prevents easy recognition by sequence homology. This gene encodes a 39S subunit protein. This gene is immediately adjacent to the gene for BAF complex 53 kDa subunit protein a (BAF53a), in a tail-to-tail orientation. Two transcript variants encoding different protein isoforms have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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| Gene Information | |||||||||||||||||||
| Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
| Genomic Location | Chromosome 3:179588285-179604654 | ||||||||||||||||||
| Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
| Band | q26.33 | ||||||||||||||||||
| Transcripts |
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| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 14 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Orthologs | |||||||||||||||||||
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Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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| Pathways | |||||||||||||||||||
| NETPATH | |||||||||||||||||||
| REACTOME |
Organelle biogenesis and maintenance pathway
Mitochondrial translation pathway
Mitochondrial translation initiation pathway
Mitochondrial translation termination pathway
Mitochondrial translation elongation pathway
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| KEGG | |||||||||||||||||||
| INOH | |||||||||||||||||||
| PID NCI | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | Q9HD33 | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 57129 | ||||||||||||||||||
| UniGene | |||||||||||||||||||
| RefSeq | NM_020409 NM_177988 | ||||||||||||||||||
| HUGO | HGNC:16652 | ||||||||||||||||||
| OMIM | 611852 | ||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS3232 CCDS3233 | ||||||||||||||||||
| HPRD | 14766 | ||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | AC090425 AF285120 AY212270 BC021575 BC032522 CH471052 | ||||||||||||||||||
| GenPept | AAG01157 AAH21575 AAH32522 AAO92749 EAW78395 EAW78396 | ||||||||||||||||||
| RNA Seq Atlas | 57129 | ||||||||||||||||||