Mus musculus Gene: Sox1 | |||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-706410.2 | ||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||
Gene Symbol | Sox1 | ||||||||||||||||
Gene Name | SRY-box containing gene 1 | ||||||||||||||||
Synonyms | BB176347; Sox-1 | ||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000096014 | ||||||||||||||||
Encoded Proteins | |||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000182968:
This intronless gene encodes a member of the SOX (SRY-related HMG-box) family of transcription factors involved in the regulation of embryonic development and in the determination of the cell fate. The encoded protein may act as a transcriptional activator after forming a protein complex with other proteins. In mice, a similar protein regulates the gamma-crystallin genes and is essential for lens development. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 8:12395295-12400126 | ||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||
Band | A1.1 | ||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||
NETPATH |
Wnt pathway
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REACTOME | |||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||
SwissProt | P53783 | ||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||
Entrez Gene | 20664 | ||||||||||||||||
UniGene | Mm.39088 | ||||||||||||||||
RefSeq | NM_009233 | ||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||
CCDS | CCDS57605 | ||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||
MGI ID | MGI:98357 | ||||||||||||||||
MGI Symbol | Sox1 | ||||||||||||||||
EMBL | AB108672 AC102525 X94126 | ||||||||||||||||
GenPept | BAC75667 CAA63846 | ||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 20664 | ||||||||||||||||