Version 5.4
| Homo sapiens Gene: NLRP13 | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-71230.6 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | NLRP13 | ||||||||||||||||||
| Gene Name | NLR family, pyrin domain containing 13 | ||||||||||||||||||
| Synonyms | |||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Gene | ENSG00000173572 | ||||||||||||||||||
| Encoded Proteins |
NLR family, pyrin domain containing 13
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| Protein Structure |
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| Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
| InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||
| Summary |
NLRP13 is a part of the NLRP (Nucleotide-binding oligomerization domain, Leucine rich Repeat and Pyrin domain containing) family, has a role in apoptosis and inflammation.
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| Entrez Gene | |||||||||||||||||||
| Summary |
NALPs are cytoplasmic proteins that form a subfamily within the larger CATERPILLER protein family. Most short NALPs, such as NALP13, have an N-terminal pyrin (MEFV; MIM 608107) domain (PYD), followed by a NACHT domain, a NACHT-associated domain (NAD), and a C-terminal leucine-rich repeat (LRR) region. The long NALP, NALP1 (MIM 606636), also has a C-terminal extension containing a function to find domain (FIIND) and a caspase recruitment domain (CARD). NALPs are implicated in the activation of proinflammatory caspases (e.g., CASP1; MIM 147678) via their involvement in multiprotein complexes called inflammasomes (Tschopp et al., 2003 [PubMed 12563287]).[supplied by OMIM, Mar 2008] |
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| Gene Information | |||||||||||||||||||
| Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
| Genomic Location | Chromosome 19:55891699-55932336 | ||||||||||||||||||
| Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
| Band | q13.43 | ||||||||||||||||||
| Transcripts |
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| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Orthologs | |||||||||||||||||||
| No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | Q86W25 | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 126204 | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.446924 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NM_176810 XM_005258510 | ||||||||||||||||||
| HUGO | HGNC:22937 | ||||||||||||||||||
| OMIM | 609660 | ||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS33119 | ||||||||||||||||||
| HPRD | 14804 | ||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | AY154468 BK001108 | ||||||||||||||||||
| GenPept | AAO18164 DAA01241 | ||||||||||||||||||
| RNA Seq Atlas | 126204 | ||||||||||||||||||