Homo sapiens Gene: JMJD7-PLA2G4B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-7368.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | JMJD7-PLA2G4B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | JMJD7-PLA2G4B readthrough | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | cPLA2-beta; HsT16992 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000168970 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
JMJD7-PLA2G4B readthrough
JMJD7-PLA2G4B readthrough
JMJD7-PLA2G4B readthrough
JMJD7-PLA2G4B readthrough
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of the cytosolic phospholipase A2 protein family. Phospholipase A2 enzymes hydrolyze the sn-2 bond of phospholipids, releasing lysophospholipids and fatty acids. This enzyme may be associated with mitochondria and early endosomes. Most tissues also express read-through transcripts from the upstream gene into this gene, some of which may encode fusion proteins combining the N-terminus of the upstream gene including its JmjC domain with the almost complete coding region of this gene, including the C2 and cytoplasmic phospholipase A2 domains. [provided by RefSeq, Jul 2008] This gene transcribes naturally-occurring mRNAs that are read-through products of the neighboring jumonji domain containing 7 (JMJD7) and phospholipase A2, group IVB (PLA2G4B) genes. These read-through products contain in-frame segments from both genes but a function has yet to be determined for the predicted fusion proteins, which contain a partial JmjC domain and downstream C2 and phospholipase A2 domains. Alternatively spliced transcript variants have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2011] This gene encodes a highly conserved protein with a JmjC domain, which are part of the cupin metalloenzyme superfamily. JmjC proteins may function as 2-oxoglutarate-Fe(II)-dependent dioxygenases. Most tissues also express read-through transcripts from this gene into the downstream phospholipase A2, group IVB (cytosolic) gene, some of which may encode fusion proteins combining the N-terminus of this protein with the phospholipase A2, group IVB protein. [provided by RefSeq, Jul 2008] This locus represents naturally-occurring readthrough transcription between the neighboring jumonji domain containing 7 (JMJD7) and phospholipase A2, group IVB (cytosolic) (PLA2G4B) genes. Readthrough transcripts encode fusion proteins that share amino acid sequence with each individual gene product, including a partial JmjC domain and downstream C2 and phospholipase A2 domains. Alternatively spliced transcript variants have been observed. [provided by RefSeq, Oct 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:41828095-41848155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q15.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 6 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
XBP1(S) activates chaperone genes pathway
IRE1alpha activates chaperones pathway
Acyl chain remodelling of PC pathway
Hydrolysis of LPC pathway
Acyl chain remodelling of PS pathway
Synthesis of PA pathway
Acyl chain remodelling of PG pathway
Acyl chain remodelling of PE pathway
Unfolded Protein Response (UPR) pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Glycerophospholipid biosynthesis pathway
Metabolism of proteins pathway
Phospholipid metabolism pathway
Metabolism pathway
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KEGG |
alpha-Linolenic acid metabolism pathway
GnRH signaling pathway pathway
Arachidonic acid metabolism pathway
VEGF signaling pathway pathway
Fc epsilon RI signaling pathway pathway
MAPK signaling pathway pathway
Glycerophospholipid metabolism pathway
Linoleic acid metabolism pathway
Long-term depression pathway
Ether lipid metabolism pathway
Fc gamma R-mediated phagocytosis pathway
Vascular smooth muscle contraction pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.736789 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001114633 NM_001198588 NM_005090 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS32202 CCDS45241 CCDS55961 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 07306 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||