Homo sapiens Gene: LBP | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-74721.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | LBP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | lipopolysaccharide binding protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | BPIFD2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000129988 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
lipopolysaccharide binding protein
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is involved in the acute-phase immunologic response to gram-negative bacterial infections. Gram-negative bacteria contain a glycolipid, lipopolysaccharide (LPS), on their outer cell wall. Together with bactericidal permeability-increasing protein (BPI), the encoded protein binds LPS and interacts with the CD14 receptor, probably playing a role in regulating LPS-dependent monocyte responses. Studies in mice suggest that the encoded protein is necessary for the rapid acute-phase response to LPS but not for the clearance of LPS from circulation. This protein is part of a family of structurally and functionally related proteins, including BPI, plasma cholesteryl ester transfer protein (CETP), and phospholipid transfer protein (PLTP). [provided by RefSeq, Apr 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 20:38346356-38377023 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q11.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 23 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Transfer of LPS from LBP carrier to CD14 pathway
Toll Like Receptor 4 (TLR4) Cascade pathway
Innate Immune System pathway
Toll-Like Receptors Cascades pathway
Immune System pathway
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KEGG |
Toll-like receptor signaling pathway pathway
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INOH |
Toll-like receptor signaling pathway pathway
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PID NCI |
IL6-mediated signaling events
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P18428 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 3929 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.154078 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_004139 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:6517 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 151990 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS13304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF013500 AF013501 AF013502 AF013503 AF013504 AF013505 AF013506 AF013507 AF013508 AF013509 AF013510 AF013511 AF013512 AF105067 AK313625 AL080249 CH471077 L42172 M35533 X98657 X98658 X98659 X98660 X98661 X98662 X98663 X98664 X98665 X98666 X98667 X98668 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA59493 AAA66446 AAC39547 AAD21962 BAG36385 CAA67226 CAC10462 EAW76034 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 3929 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||