Homo sapiens Gene: ITGA6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-75102.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | ITGA6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | integrin, alpha 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CD49f; ITGA6B; VLA-6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000091409 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
integrin, alpha 6
integrin, alpha 6
integrin, alpha 6
integrin, alpha 6
integrin, alpha 6
integrin, alpha 6
integrin, alpha 6
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The ITGA6 protein product is the integrin alpha chain alpha 6. Integrins are integral cell-surface proteins composed of an alpha chain and a beta chain. A given chain may combine with multiple partners resulting in different integrins. For example, alpha 6 may combine with beta 4 in the integrin referred to as TSP180, or with beta 1 in the integrin VLA-6. Integrins are known to participate in cell adhesion as well as cell-surface mediated signalling. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:172427354-172506282 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q31.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 16 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
Alpha6Beta4Integrin pathway
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REACTOME |
Basigin interactions pathway
Cell surface interactions at the vascular wall pathway
Integrin cell surface interactions pathway
Assembly of collagen fibrils and other multimeric structures pathway
Type I hemidesmosome assembly pathway
Cell-Cell communication pathway
Extracellular matrix organization pathway
Cell junction organization pathway
Syndecan interactions pathway
Non-integrin membrane-ECM interactions pathway
Laminin interactions pathway
Collagen formation pathway
Hemostasis pathway
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KEGG |
Regulation of actin cytoskeleton pathway
Hematopoietic cell lineage pathway
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
ECM-receptor interaction pathway
Small cell lung cancer pathway
Focal adhesion pathway
Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy (ARVC) pathway
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) pathway
Pathways in cancer pathway
Dilated cardiomyopathy pathway
Toxoplasmosis pathway
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INOH |
Integrin signaling pathway pathway
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PID NCI |
Beta1 integrin cell surface interactions
Integrin family cell surface interactions
a6b1 and a6b4 Integrin signaling
Validated targets of C-MYC transcriptional repression
Alpha6 beta4 integrin-ligand interactions
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.133397 Hs.613769 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_000210 NM_001079818 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS2249 CCDS46451 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 00945 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||