Version 5.4
| Homo sapiens Gene: GALNT12 | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-78414.6 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | GALNT12 | ||||||||||||||||||
| Gene Name | UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 12 (GalNAc-T12) | ||||||||||||||||||
| Synonyms | |||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Gene | ENSG00000119514 | ||||||||||||||||||
| Encoded Proteins |
UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 12 (GalNAc-T12)
polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 12
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| Protein Structure |
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| Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||
| Summary |
This gene encodes a member of a family of UDP-GalNAc:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferases, which catalyze the transfer of N-acetylgalactosamine (GalNAc) from UDP-GalNAc to a serine or threonine residue on a polypeptide acceptor in the initial step of O-linked protein glycosylation. Mutations in this gene are associated with an increased susceptibility to colorectal cancer.[provided by RefSeq, Mar 2011] |
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| Gene Information | |||||||||||||||||||
| Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
| Genomic Location | Chromosome 9:98807699-98850081 | ||||||||||||||||||
| Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
| Band | q22.33 | ||||||||||||||||||
| Transcripts |
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| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Orthologs | |||||||||||||||||||
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Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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| Pathways | |||||||||||||||||||
| NETPATH | |||||||||||||||||||
| REACTOME |
O-linked glycosylation of mucins pathway
Post-translational protein modification pathway
O-linked glycosylation pathway
Metabolism of proteins pathway
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| KEGG |
Mucin type O-Glycan biosynthesis pathway
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| INOH | |||||||||||||||||||
| PID NCI | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | Q8IXK2 | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 79695 | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.47099 Hs.604435 Hs.607606 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NM_024642 XM_006717287 | ||||||||||||||||||
| HUGO | HGNC:19877 | ||||||||||||||||||
| OMIM | 610290 | ||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS6737 | ||||||||||||||||||
| HPRD | 13561 | ||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | AB078146 AJ132365 AK024865 AL136084 BC013945 | ||||||||||||||||||
| GenPept | AAH13945 BAB15027 BAC07181 CAC80100 CAI17042 | ||||||||||||||||||
| RNA Seq Atlas | 79695 | ||||||||||||||||||