Homo sapiens Gene: GPANK1 | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-78501.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | GPANK1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | G patch domain and ankyrin repeats 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | ANKRD59; BAT4; D6S54E; G5; GPATCH10 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000204438 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
G patch domain and ankyrin repeats 1
G patch domain and ankyrin repeats 1
G patch domain and ankyrin repeats 1
G patch domain and ankyrin repeats 1
G patch domain and ankyrin repeats 1
G patch domain and ankyrin repeats 1
G patch domain and ankyrin repeats 1
G patch domain and ankyrin repeats 1
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene is located in a cluster of HLA-B-associated transcripts, which is included in the human major histocompatability complex III region. This gene encodes a protein which is thought to play a role in immunity. Multiple alternatively spliced variants, encoding the same protein, have been identified. [provided by RefSeq, Nov 2010] |
||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:31661229-31666283 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p21.33 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 10 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F6QYZ9 F6UZA3 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 7918 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.247478 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001199237 NM_001199238 NM_001199239 NM_001199240 NM_033177 XM_005249403 XM_005275179 XM_005275302 XM_006715204 XM_006725847 XM_006725935 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:13920 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 142610 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS4711 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 00810 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AL662899 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 7918 | ||||||||||||||||||||||