Homo sapiens Gene: C1GALT1C1 | |||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-84600.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | C1GALT1C1 | ||||||||||||||||||
Gene Name | C1GALT1-specific chaperone 1 | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000171155 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
C1GALT1-specific chaperone 1
C1GALT1-specific chaperone 1
|
||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a type II transmembrane protein that is similar to the core 1 beta1,3-galactosyltransferase 1, which catalyzes the synthesis of the core-1 structure, also known as Thomsen-Friedenreich antigen, on O-linked glycans. This gene product lacks the galactosyltransferase activity itself, but instead acts as a molecular chaperone required for the folding, stability and full activity of the core 1 beta1,3-galactosyltransferase 1. Mutations in this gene have been associated with Tn syndrome. Alternatively spliced transcript variants encoding the same protein have been identified. [provided by RefSeq, Dec 2009] |
||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome X:120625793-120630150 | ||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
Band | q24 | ||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
|
||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
O-linked glycosylation of mucins pathway
Post-translational protein modification pathway
O-linked glycosylation pathway
Metabolism of proteins pathway
|
||||||||||||||||||
KEGG |
Mucin type O-Glycan biosynthesis pathway
|
||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
UniGene | Hs.713843 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001011551 NM_152692 | ||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS14602 | ||||||||||||||||||
HPRD | 06462 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||