Homo sapiens Gene: POMT1 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-89966.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | POMT1 | ||||||||||||||||||
Gene Name | protein-O-mannosyltransferase 1 | ||||||||||||||||||
Synonyms | LGMD2K; MDDGA1; MDDGB1; MDDGC1; RT | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000130714 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
protein-O-mannosyltransferase 1
protein-O-mannosyltransferase 1
protein-O-mannosyltransferase 1
protein-O-mannosyltransferase 1
protein-O-mannosyltransferase 1
protein-O-mannosyltransferase 1
protein-O-mannosyltransferase 1
protein-O-mannosyltransferase 1
protein-O-mannosyltransferase 1
protein-O-mannosyltransferase 1
protein-O-mannosyltransferase 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is an O-mannosyltransferase that requires interaction with the product of the POMT2 gene for enzymatic function. The encoded protein is found in the membrane of the endoplasmic reticulum. Defects in this gene are a cause of Walker-Warburg syndrome (WWS) and limb-girdle muscular dystrophy type 2K (LGMD2K). Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.[provided by RefSeq, Oct 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:131502902-131523806 | ||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
Band | q34.13 | ||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||
KEGG |
Other types of O-glycan biosynthesis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001077365 NM_001077366 NM_001136113 NM_001136114 NM_007171 XM_005272156 XM_005272158 XM_005272159 XM_006716932 | ||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS43894 CCDS43895 CCDS48045 CCDS6943 | ||||||||||||||||||
HPRD | 06305 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||