Homo sapiens Gene: L1CAM | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-90096.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | L1CAM | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | L1 cell adhesion molecule | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CAML1; CD171; HSAS; HSAS1; MASA; MIC5; N-CAM-L1; N-CAML1; NCAM-L1; S10; SPG1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000198910 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
L1 cell adhesion molecule
L1 cell adhesion molecule
L1 cell adhesion molecule
L1 cell adhesion molecule
L1 cell adhesion molecule
L1 cell adhesion molecule
L1 cell adhesion molecule
L1 cell adhesion molecule
L1 cell adhesion molecule
L1 cell adhesion molecule
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is an axonal glycoprotein belonging to the immunoglobulin supergene family. The ectodomain, consisting of several immunoglobulin-like domains and fibronectin-like repeats (type III), is linked via a single transmembrane sequence to a conserved cytoplasmic domain. This cell adhesion molecule plays an important role in nervous system development, including neuronal migration and differentiation. Mutations in the gene cause three X-linked neurological syndromes known by the acronym CRASH (corpus callosum hypoplasia, retardation, aphasia, spastic paraplegia and hydrocephalus). Alternative splicing of a neuron-specific exon is thought to be functionally relevant. [provided by RefSeq, Jul 2008] The protein encoded by this gene is an axonal glycoprotein belonging to the immunoglobulin supergene family. The ectodomain, consisting of several immunoglobulin-like domains and fibronectin-like repeats (type III), is linked via a single transmembrane sequence to a conserved cytoplasmic domain. This cell adhesion molecule plays an important role in nervous system development, including neuronal migration and differentiation. Mutations in the gene cause X-linked neurological syndromes known as CRASH (corpus callosum hypoplasia, retardation, aphasia, spastic paraplegia and hydrocephalus). Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants, some of which include an alternate exon that is considered to be specific to neurons. [provided by RefSeq, May 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome X:153861514-153909223 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 21 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Basigin interactions pathway
Cell surface interactions at the vascular wall pathway
Signal transduction by L1 pathway
Recycling pathway of L1 pathway
Interaction between L1 and Ankyrins pathway
L1CAM interactions pathway
Developmental Biology pathway
Axon guidance pathway
Hemostasis pathway
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KEGG |
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
Axon guidance pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Beta3 integrin cell surface interactions
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.522818 Hs.735809 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_000425 NM_001143963 NM_001278116 NM_024003 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS14733 CCDS14734 CCDS48192 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 02394 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||