Homo sapiens Gene: GRIK2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-94705.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | GRIK2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | glutamate receptor, ionotropic, kainate 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | EAA4; GLR6; GluK2; GLUK6; GLUR6; MRT6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000164418 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
glutamate receptor, ionotropic, kainate 2
glutamate receptor, ionotropic, kainate 2
glutamate receptor, ionotropic, kainate 2
glutamate receptor, ionotropic, kainate 2
glutamate receptor, ionotropic, kainate 2
glutamate receptor, ionotropic, kainate 2
glutamate receptor, ionotropic, kainate 2
glutamate receptor, ionotropic, kainate 2
glutamate receptor, ionotropic, kainate 2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Glutamate receptors are the predominant excitatory neurotransmitter receptors in the mammalian brain and are activated in a variety of normal neurophysiologic processes. This gene product belongs to the kainate family of glutamate receptors, which are composed of four subunits and function as ligand-activated ion channels. The subunit encoded by this gene is subject to RNA editing at multiple sites within the first and second transmembrane domains, which is thought to alter the structure and function of the receptor complex. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have also been described for this gene. Mutations in this gene have been associated with autosomal recessive mental retardation. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:101398788-102070083 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q16.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 19 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Activation of Na-permeable Kainate Receptors pathway
Neuronal System pathway
Ionotropic activity of Kainate Receptors pathway
Activation of Kainate Receptors upon glutamate binding pathway
Transmission across Chemical Synapses pathway
Activation of Ca-permeable Kainate Receptor pathway
Neurotransmitter Receptor Binding And Downstream Transmission In The Postsynaptic Cell pathway
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KEGG |
Neuroactive ligand-receptor interaction pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.605579 Hs.98262 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001166247 NM_021956 NM_175768 XM_005266945 XM_005266946 XM_006715465 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS5048 CCDS5049 CCDS55045 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 00692 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||