Homo sapiens Gene: CLDN19 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-97247.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | CLDN19 | ||||||||||||||||||
Gene Name | claudin 19 | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000164007 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
claudin 19
claudin 19
claudin 19
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
The product of this gene belongs to the claudin family. It plays a major role in tight junction-specific obliteration of the intercellular space, through calcium-independent cell-adhesion activity. Defects in this gene are the cause of hypomagnesemia renal with ocular involvement (HOMGO). HOMGO is a progressive renal disease characterized by primary renal magnesium wasting with hypomagnesemia, hypercalciuria and nephrocalcinosis associated with severe ocular abnormalities such as bilateral chorioretinal scars, macular colobomata, significant myopia and nystagmus. Alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:42733093-42740254 | ||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
Band | p34.2 | ||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
Tight junction interactions pathway
Cell-Cell communication pathway
Cell junction organization pathway
Cell-cell junction organization pathway
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KEGG |
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
Leukocyte transendothelial migration pathway
Tight junction pathway
Hepatitis C pathway
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INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | Q8N6F1 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 149461 | ||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||
RefSeq | NM_148960 NM_001123395 NM_001185117 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:2040 | ||||||||||||||||||
OMIM | 610036 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS471 CCDS44125 CCDS53306 | ||||||||||||||||||
HPRD | 10834 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AC098484 AF497644 AK096063 AK298992 BC030524 CH471059 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAH30524 AAQ07256 BAC04691 BAH12918 EAX07147 | ||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 149461 | ||||||||||||||||||