Mus musculus Protein: Alkbh8 | |||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-131123.6 | ||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Alkbh8 | ||||||||||||||||||||
Protein Name | alkB, alkylation repair homolog 8 (E. coli) | ||||||||||||||||||||
Synonyms | 4930562C03Rik; 8030431D03Rik; 9430088N01Rik; Abh8; | ||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000061511 | ||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-131121 (Alkbh8) | ||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||
Function | Catalyzes the methylation of 5-carboxymethyl uridine to 5-methylcarboxymethyl uridine at the wobble position of the anticodon loop in tRNA. Catalyzes the last step in the formation of 5-methylcarboxymethyl uridine at the wobble position of the anticodon loop in target tRNA. Has a preference for tRNA(Arg) and tRNA(Glu), and does not bind tRNA(Lys). Required for normal survival after DNA damage. May inhibit apoptosis and promote cell survival and angiogenesis (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm {ECO:0000250}. Nucleus {ECO:0000250}. Note=Predominantly cytoplasmic. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1914917 | ||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000504
RNA recognition motif domain IPR005123 Oxoglutarate/iron-dependent dioxygenase IPR007823 Methyltransferase-related IPR013216 Methyltransferase type 11 IPR015095 Alkylated DNA repair protein AlkB, homologue 8, N-terminal IPR029063 S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase-like |
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PFAM |
PF00076
PF03171 PF13640 PF05148 PF08241 PF09004 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||
SMART |
SM00360
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||
SwissProt | Q80Y20 | ||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite- | ||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 67667 | ||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.402002 | ||||||||||||||||||||
RefSeq | XP_006509942 | ||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Alkbh8 | ||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS22792 | ||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||
EMBL | AK020197 AK081459 AK160783 BC050863 | ||||||||||||||||||||
GenPept | AAH50863 BAB32026 BAC38223 BAE36007 | ||||||||||||||||||||