Mus musculus Protein: Col4a1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-132202.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Col4a1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | collagen, type IV, alpha 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | Bru; Col4a-1; Del(8)44H; Raw; Svc; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000033898 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-132200 (Col4a1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Type IV collagen is the major structural component of glomerular basement membranes (GBM), forming a 'chicken-wire' meshwork together with laminins, proteoglycans and entactin/nidogen.Arresten, comprising the C-terminal NC1 domain, inhibits angiogenesis and tumor formation. The C-terminal half is found to possess the anti-angiogenic activity. Specifically inhibits endothelial cell proliferation, migration and tube formation. Inhibits expression of hypoxia-inducible factor 1alpha and ERK1/2 and p38 MAPK activation. Ligand for alpha1/beta1 integrin (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Secreted, extracellular space, extracellular matrix, basement membrane. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 14 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:88454 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001442
Collagen IV, non-collagenous IPR008160 Collagen triple helix repeat IPR016187 C-type lectin fold |
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PFAM |
PF01413
PF01391 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00111
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P02463 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P02463 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 12826 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.738 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_034061 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Col4a1 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS40219 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AK142097 AK146487 AK147284 AK147355 AK147661 BC002269 BC056620 BC072650 J03758 J03944 J04448 J04694 M12879 M13024 M13025 M13026 M13027 M13043 M14042 M15832 M23333 X02201 X06777 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA37340 AAA37342 AAA37343 AAA37344 AAA37345 AAA37346 AAA37437 AAA37439 AAA37442 AAA50292 AAA51625 AAH02269 AAH56620 AAH72650 BAE24936 BAE27208 BAE27820 BAE27863 BAE28055 CAA26132 CAA29946 | ||||||||||||||||||||||