Mus musculus Protein: Trpa1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-134727.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Trpa1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | transient receptor potential cation channel, subfamily A, member 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000043594 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-134725 (Trpa1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Receptor-activated non-selective cation channel involved in detection of pain and possibly also in cold perception and inner ear function. Has a central role in the pain response to endogenous inflammatory mediators and to a diverse array of volatile irritants, such as mustard oil, garlic and acrolein, an irritant from tears gas and vehicule exhaust fumes. Acts also as a ionotropic cannabinoid receptor by being activated by delta(9)- tetrahydrocannabinol (THC), the psychoactive component of marijuana. Not involved in menthol sensation. May be a component for the mechanosensitive transduction channel of hair cells in inner ear, thereby participating in the perception of sounds. Probably operated by a phosphatidylinositol second messenger system. {ECO:0000269PubMed:12654248, ECO:0000269PubMed:15046718, ECO:0000269PubMed:15483558, ECO:0000269PubMed:15843607}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Membrane {ECO:0000305}; Multi-pass membrane protein {ECO:0000305}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in inner ear (at protein level). Specifically expressed in a subset of nociceptive neurons. Expressed in the same neurons that TRPV1. In contrast, it is not expressed in neurons expressing TRPM8. Expressed in the superior cervical ganglion. {ECO:0000269PubMed:12654248, ECO:0000269PubMed:15194861, ECO:0000269PubMed:15483558, ECO:0000269PubMed:15843607}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:3522699 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR002110
Ankyrin repeat IPR020683 Ankyrin repeat-containing domain |
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PFAM |
PF00023
PF13606 PF11929 PF12796 |
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PRINTS |
PR01415
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00248
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8BLA8 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite- | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 277328 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.186329 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_808449 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Trpa1 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS35516 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AK045771 AY231177 BC120563 BC131963 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI20564 AAI31964 AAO43183 BAC32487 | ||||||||||||||||||||||