Mus musculus Protein: Foxa1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-141539.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Foxa1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | forkhead box A1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Hnf-3a; Hnf3a; Tcf-3a; Tcf3a; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000041118 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-141537 (Foxa1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Transcription factor that is involved in embryonic development, establishment of tissue-specific gene expression and regulation of gene expression in differentiated tissues. Is thought to act as a 'pioneer' factor opening the compacted chromatin for other proteins through interactions with nucleosomal core histones and thereby replacing linker histones at target enhancer and/or promoter sites. Binds DNA with the consensus sequence 5'-[AC]A[AT]T[AG]TT[GT][AG][CT]T[CT]-3' (By similarity). Proposed to play a role in translating the epigenetic signatures into cell type-specific enhancer-driven transcriptional programs. Involved in the development of multiple endoderm-derived organ systems such as the liver, pancreas, lungs and prostate; FOXA1 and FOXA2 seem to have at least in part redundant roles. Plays a role in prostate morphogenesis and epithelial cell differentiation. FOXA1 and FOXA2 are essential for hepatic specification. FOXA1 and FOXA2 are required for morphogenesis and cell differentiation during formation of the lung. FOXA1 and FOXA2 are involved in bile duct formation; they positively regulate the binding of glucocorticoid receptor/NR3C1 to the IL6 promoter. FOXA1 and FOXA2 regulate multiple phases of midbrain dopaminergic neuron development; they regulate expression of NEUROG2 at the beginning of mDA neurogenesis and of NR4A2 and EN1 in immature mDA neurons. Modulates the transcriptional activity of nuclear hormone receptors. Is involved in ESR1-mediated transcription. Inhibits NKX2-1-mediated transcription from the SFTPC promoter in lung epithel independently from DNA-binding. Involved in regulation of apoptosis. Involved in cell cycle regulation. Originally described as a transcription activator for a number of liver genes such as AFP, albumin, tyrosine aminotransferase, PEPCK, etc. Interacts with the cis-acting regulatory regions of these genes. Involved in glucose homeostasis; activates the GCG promoter. {ECO:0000250, ECO:0000269PubMed:10049364, ECO:0000269PubMed:11864602, ECO:0000269PubMed:15668254, ECO:0000269PubMed:15748903, ECO:0000269PubMed:15959514, ECO:0000269PubMed:15987773, ECO:0000269PubMed:17596284, ECO:0000269PubMed:19141476, ECO:0000269PubMed:19436110}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000255PROSITE- ProRule:PRU00089, ECO:0000269PubMed:15987773}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Restricted mainly to endoderm-derived tissues (lung, liver, stomach, and small intestine). Expressed in the prostate. {ECO:0000269PubMed:15987773}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 25 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 10 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1347472 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001766
Transcription factor, fork head IPR013638 Fork-head N-terminal IPR018533 Forkhead box protein, C-terminal |
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PFAM |
PF00250
PF08430 PF09354 |
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PRINTS |
PR00053
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00339
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P35582 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P35582 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 15375 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.4578 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_032285 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Foxa1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS25926 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | BC096524 U44752 X74936 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA86760 AAH96524 CAA52890 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||