Version 5.4
| Homo sapiens Protein: ZFR | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Protein | IDBP-14602.6 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | ZFR | ||||||||||||||||||
| Protein Name | zinc finger RNA binding protein | ||||||||||||||||||
| Synonyms | |||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Protein | ENSP00000265069 | ||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-14600 (ZFR) | ||||||||||||||||||
| Protein Structure |
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| UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
| Function | Involved in postimplantation and gastrulation stages of development. Involved in the nucleocytoplasmic shuttling of STAU2. Binds to DNA and RNA (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||
| Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000250}. Cytoplasm {ECO:0000250}. Cytoplasmic granule {ECO:0000250}. Chromosome {ECO:0000250}. Note=Associated with chromosome foci in meiotic cells. Localizes in somatodendritic compartment of primary hippocampal neurons. Colocalizes with STAU2 in several cytosolic RNA granules (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||
| Disease Associations | |||||||||||||||||||
| Tissue Specificity | Expressed in lung, liver, lymphocytes, heart, pancreas, placenta, brain and kidney. {ECO:0000269PubMed:11574164}. | ||||||||||||||||||
| Comments | |||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 42 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
| PDB ID | |||||||||||||||||||
| InterPro |
IPR003604
Zinc finger, U1-type IPR006561 DZF domain IPR015880 Zinc finger, C2H2-like IPR022755 Zinc finger, double-stranded RNA binding |
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| PFAM |
PF07528
PF12171 |
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| PRINTS | |||||||||||||||||||
| PIRSF | |||||||||||||||||||
| SMART |
SM00451
SM00572 SM00355 |
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| TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
| Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
| Modification | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | Q96KR1 | ||||||||||||||||||
| PhosphoSite | PhosphoSite-Q96KR1 | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | B3KP82 | ||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 51663 | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.435231 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_057191 | ||||||||||||||||||
| HUGO | HGNC:17277 | ||||||||||||||||||
| OMIM | 615635 | ||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS34139 | ||||||||||||||||||
| HPRD | 15730 | ||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | AC008949 AF100742 AJ314790 AK025481 AK055938 AK295297 AL137258 BC030540 BC051893 BC062986 BC107417 BC137084 | ||||||||||||||||||
| GenPept | AAD40385 AAH30540 AAH51893 AAH62986 AAI07418 AAI37085 BAB15147 BAG51594 BAG58279 CAB70659 CAC40818 | ||||||||||||||||||