Mus musculus Protein: Smc4 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-151133.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Smc4 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | structural maintenance of chromosomes 4 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2500002A22Rik; C79747; SMC-4; Smc4l1; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000047872 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-151131 (Smc4) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Central component of the condensin complex, a complex required for conversion of interphase chromatin into mitotic-like condense chromosomes. The condensin complex probably introduces positive supercoils into relaxed DNA in the presence of type I topoisomerases and converts nicked DNA into positive knotted forms in the presence of type II topoisomerases (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000250}. Cytoplasm {ECO:0000250}. Chromosome {ECO:0000250}. Note=In interphase cells, the majority of the condensin complex is found in the cytoplasm, while a minority of the complex is associated with chromatin. A subpopulation of the complex however remains associated with chromosome foci in interphase cells. During mitosis, most of the condensin complex is associated with the chromatin. At the onset of prophase, the regulatory subunits of the complex are phosphorylated by CDC2, leading to condensin's association with chromosome arms and to chromosome condensation. Dissociation from chromosomes is observed in late telophase (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 22 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1917349 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR003395
RecF/RecN/SMC, N-terminal IPR009053 Prefoldin IPR010935 SMCs flexible hinge IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF02463
PF06470 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00968
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8CG47 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q8CG47 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q6P7V9 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 70099 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.458564 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_598547 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | 3L51 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Smc4 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS17401 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC122876 AJ534940 AK088350 AK088846 AK141703 AK152804 BC005507 BC061481 BC062939 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH05507 AAH61481 AAH62939 BAC40297 BAC40608 BAE24807 BAE31509 CAD59183 | ||||||||||||||||||||||