Homo sapiens Protein: PRPF8 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-15310.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PRPF8 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | PRP8 pre-mRNA processing factor 8 homolog (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | HPRP8; PRP8; PRPC8; RP13; SNRNP220; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000304350 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-15306 (PRPF8) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Functions as a scaffold that mediates the ordered assembly of spliceosomal proteins and snRNAs. Required for the assembly of the U4/U6-U5 tri-snRNP complex. Functions as scaffold that positions spliceosomal U2, U5 and U6 snRNAs at splice sites on pre-mRNA substrates, so that splicing can occur. Interacts with both the 5' and the 3' splice site. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus speckle {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Retinitis pigmentosa 13 (RP13) [MIM:600059]: A retinal dystrophy belonging to the group of pigmentary retinopathies. Retinitis pigmentosa is characterized by retinal pigment deposits visible on fundus examination and primary loss of rod photoreceptor cells followed by secondary loss of cone photoreceptors. Patients typically have night vision blindness and loss of midperipheral visual field. As their condition progresses, they lose their far peripheral visual field and eventually central vision as well. {ECO:0000269PubMed:11468273, ECO:0000269PubMed:11910553, ECO:0000269PubMed:12714658, ECO:0000269Ref.31}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry. | ||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Widely expressed. {ECO:0000269PubMed:10411133}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 150 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000555
JAB1/MPN/MOV34 metalloenzyme domain IPR008972 Cupredoxin IPR009072 Histone-fold IPR012591 PRO8NT domain IPR012592 PROCN domain IPR012984 PROCT domain IPR019580 Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, U6-snRNA-binding IPR019581 Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, U5-snRNA-binding IPR019582 RNA recognition motif, spliceosomal PrP8 IPR021983 PRP8 domain IV core |
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PFAM |
PF01398
PF08082 PF08083 PF08084 PF10596 PF10597 PF10598 PF12134 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00232
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q6P2Q9 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q6P2Q9 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 10594 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.181368 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_006436 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:17340 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 607300 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS11010 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 06295 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB007510 AF092565 BC064370 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC61776 AAH64370 BAA22563 | ||||||||||||||||||||||