Mus musculus Protein: Thoc3 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-153443.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Thoc3 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | THO complex 3 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2410044K02Rik; AL033344; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000026990 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-153441 (Thoc3) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Required for efficient export of polyadenylated RNA and spliced mRNA. Acts as component of the THO subcomplex of the TREX complex which is thought to couple mRNA transcription, processing and nuclear export, and which specifically associates with spliced mRNA and not with unspliced pre-mRNA. TREX is recruited to spliced mRNAs by a transcription-independent mechanism, binds to mRNA upstream of the exon-junction complex (EJC) and is recruited in a splicing- and cap-dependent manner to a region near the 5' end of the mRNA where it functions in mRNA export to the cytoplasm via the TAP/NFX1 pathway (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000305}. Nucleus speckle {ECO:0000305}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 22 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1920916 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001680
WD40 repeat IPR011659 WD40-like Beta Propeller IPR013979 Translation initiation factor, beta propellor-like domain IPR017986 WD40-repeat-containing domain IPR020472 G-protein beta WD-40 repeat |
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PFAM |
PF00400
PF07676 PF08662 |
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PRINTS |
PR00320
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00320
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8VE80 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q8VE80 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 73666 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.292487 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_082873 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Thoc3 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS26527 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AK010668 BC019603 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH19603 BAB27103 | ||||||||||||||||||||||