Mus musculus Protein: Otx1 | |||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-153663.6 | ||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Otx1 | ||||||||||||||||||||
Protein Name | orthodenticle homolog 1 (Drosophila) | ||||||||||||||||||||
Synonyms | A730044F23Rik; jv; | ||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000006071 | ||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-153661 (Otx1) | ||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||
Function | Probably plays a role in the development of the brain and the sense organs. Can bind to the BCD target sequence (BTS): 5'-TCTAATCCC-3'. | ||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000305}. | ||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Brain: restricted regions of the developing rostral brain including the presumptive cerebral cortex and olfactory bulbs; expressed in the developing olfactory, auricolar and ocular systems, including the covering of the optic nerve. | ||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:97450 | ||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001356
Homeobox domain IPR003025 Transcription factor Otx IPR003026 Transcription factor Otx1 IPR009057 Homeodomain-like IPR013851 Transcription factor Otx, C-terminal |
||||||||||||||||||||
PFAM |
PF00046
PF03529 |
||||||||||||||||||||
PRINTS |
PR01255
PR01256 |
||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||
SMART |
SM00389
|
||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||
SwissProt | P80205 | ||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite- | ||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q5SS54 | ||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 18423 | ||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.129663 | ||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_035153 | ||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Otx1 | ||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS24468 | ||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||
EMBL | AK042975 AK158588 AL669858 BC057105 BC058354 CH466595 X68883 | ||||||||||||||||||||
GenPept | AAH57105 AAH58354 BAC31425 BAE34569 CAA48754 EDL07858 EDL07859 | ||||||||||||||||||||