Mus musculus Protein: H2afx | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-156785.6 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | H2afx | ||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | H2A histone family, member X | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AW228881; gammaH2ax; H2A.X; H2ax; Hist5-2ax; | ||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000051432 | ||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-156783 (H2afx) | ||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||
Function | Variant histone H2A which replaces conventional H2A in a subset of nucleosomes. Nucleosomes wrap and compact DNA into chromatin, limiting DNA accessibility to the cellular machineries which require DNA as a template. Histones thereby play a central role in transcription regulation, DNA repair, DNA replication and chromosomal stability. DNA accessibility is regulated via a complex set of post-translational modifications of histones, also called histone code, and nucleosome remodeling. Required for checkpoint-mediated arrest of cell cycle progression in response to low doses of ionizing radiation and for efficient repair of DNA double strand breaks (DSBs) specifically when modified by C- terminal phosphorylation. {ECO:0000269PubMed:11740565, ECO:0000269PubMed:11934988, ECO:0000269PubMed:12034884, ECO:0000269PubMed:12447390, ECO:0000269PubMed:12660252, ECO:0000269PubMed:12689589, ECO:0000269PubMed:12792649, ECO:0000269PubMed:12914700, ECO:0000269PubMed:12914701, ECO:0000269PubMed:14530383, ECO:0000269PubMed:15574327, ECO:0000269PubMed:15580272, ECO:0000269PubMed:15589157, ECO:0000269PubMed:15610743, ECO:0000269PubMed:15632067}. | ||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. Chromosome. | ||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Most abundant in testis, thymus and spleen. {ECO:0000269PubMed:11242108}. | ||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 26 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 217 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:102688 | ||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR002119
Histone H2A IPR003958 Transcription factor CBF/NF-Y/archaeal histone IPR007125 Histone core IPR009072 Histone-fold |
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PFAM |
PF00808
PF00125 |
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PRINTS |
PR00620
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00414
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P27661 | ||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P27661 | ||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 15270 | ||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.245931 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_034566 | ||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | H2afx | ||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS23105 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | BC005468 BC010336 X58069 Z35401 | ||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH05468 AAH10336 CAA41099 CAA84585 | ||||||||||||||||||||||||||